La historia del Archivo Arzobispal de Lima, está ligada íntimamente a los acontecimientos que afectaron a la administración eclesiástica del Arzobispado de Lima, que en el siglo XVI abarcaba desde Panamá hasta Chile.

El caos que dominó la sociedad de principios del siglo XVI tuvo también efecto en su documentación. Se sabe, gracias a los relatos de los cronistas, del poco escrúpulo que tuvieron Gonzalo Pizarro y los demás protagonistas de las guerras civiles, para sustraer papeles que comprometían sus intereses.

Plano de Cusco S. XVII (1643)

En este aspecto, tanto la Corona Real como el Papado siempre estuvieron atentos a través de la emisión de reales cédulas y de bulas para que todos los documentos de la Iglesia estuviesen resguardados y ordenados.

Sin embargo, el Archivo de la Curia Eclesiástica, que era el nombre como se le conocía al Archivo Arzobispal de Lima, recién va a ser considerado como tal, en el siglo XX.  En los siglos pasados, sólo habían sido volúmenes en orden.

En la década de los años cuarenta, el sacerdote e historiador Rubén Vargas Ugarte SJ, tuvo un papel preponderante en la revaloración de toda la documentación que se conservaba en el Archivo. 

Después del terremoto que sufrió Lima en 1940, los documentos quedaron abandonados en una habitación cuyas paredes estaban derruidas. Vargas Ugarte, como buen historiador, reconoció la importancia de esos papeles y solicitó que se pusieran a buen recaudo.  Por tal motivo, el Cabildo Eclesiástico Metropolitano, cedió una antigua casa en la calle Santa Apolonia, a espaldas de la Catedral.

El 27 de abril de 1967, Día de Santo Toribio de Mogrovejo (Patrón de nuestro Arzobispado), se creó el Archivo Arzobispal de Lima, con el fin de brindar las partidas de nacimiento de los primeros limeños a sus descendientes y prestar servicio a los distintos investigadores que hasta entonces, sólo habían tenido acceso a la información de manera desordenada.

Se nombró a Monseñor Valentín Trujillo como primer director, y al señor Mario Ormeño como responsable del ordenamiento de la documentación histórica.

Libro de la Causa Sta. Rosa (S. XVII)

A lo largo de su historia el Archivo Arzobispal ha sufrido la pérdida de algunos documentos, no mellando esto en nada el valor histórico que guardan sus ambientes.

El Archivo Arzobispal, atendió en este local hasta inicios de la década del 90; sin embargo, sus instalaciones quedaron pequeñas para albergar la inmensa cantidad de documentos.  Otro factor en contra fue la antigüedad de la casa (de inicios del siglo XX), que hacía peligrar la integridad de los documentos; los continuos atentados terroristas (uno de ellos había destruido los balcones del local) y los movimientos sísmicos a los que estamos tan habituados los limeños.

Por tal razón, el entonces Arzobispo de Lima, Eminentísimo Señor Cardenal Augusto Vargas Alzamora SJ, cedió en 1998, un local anexo al Seminario Santo Toribio, en Pueblo Libre, mucho más amplio, evitando que la documentación se deteriorara.

Con el correr del tiempo se hizo necesario pensar en otro local para resguardar tan valioso patrimonio documental, ya que la humedad y la polución lo amenazaba.

Por ello, nuestro Arzobispo y Primado del Perú, Cardenal Juan Luis Cipriani Thorne, decidió adaptar las instalaciones de la casa del Cardenal Juan Landázuri Ricketts, en lo que hoy es su nuevo local, Calle Luis Espejo 1064, Urbanización Santa Catalina.